La importación se hace en línea de comandos. Si es un servidor remoto accedemos mediante SSH
Entrar mediante ssh al servidor
ssh
Entrar a la base de datos, previamente creada con Phpmyadmin
mysql -h localhost -u usuario_basedatos -p
Para usar la base de datos
show databases;
use mibasededatos;
Realizar la importación
source /var/www/dominio/web/baseaimportar.sql
Copia de Seguridad con MYSQLDUMP
Ejecuta el siguiente comando para realizar una copia de seguridad completa de la base de datos llamada NOMBRE_BASE_DE_DATOS. No olvides reemplazar TU_USUARIO y TU_CONTRASEÑA por las credenciales que utilizas para acceder al servidor de base de datos:
$ mysqldump --user=TU_USUARIO --password=TU_CONTRASEÑA NOMBRE_BASE_DE_DATOS > copia_seguridad.sql